甘肃农业大学最好的二本专业包括以下几个：

水利水电工程：

这个专业被认为是最好的二本专业，并且已经升为一本。

动物科学：

这个专业的学生通常在大三后期会有大量实验，许多老师都喜欢要男学生，未来就业也会顺利一些。

草业科学：

这个专业在全国排名前三位（根据教育部第四轮学科评比）。

市场营销：

经济管理学院的5个专业都能报，文科生学市场营销就业较好。

环境工程：

这个专业可以学到很多知识。

财务管理：

特别是男生，就业情况较好。

作物学：

这个专业也是学校的一个强项。

兽医学：

这个专业在就业和考研方面都有不错的表现。

农业工程：

这个专业也是一个值得考虑的方向。

林学：

这个专业在林业领域有较高的声誉。

风景园林学：

这个专业在园林设计和管理方面有很好的应用前景。

这些专业在就业和学术方面都有不错的表现，建议根据个人兴趣和职业规划选择合适的专业。