短隧道施工的取费合理方法应综合考虑多个因素，以确保既符合市场行情，又能准确反映工程成本。以下是几个关键要点和建议：

综合单价法

根据人工费、材料设备费、机械费、管理费和利润等计算综合单价。

适用于可以明确计算工程量的措施项目，如混凝土模板、脚手架、垂直运输等。

参数法计价

通过一定的基数乘以系数或自定义公式进行计算。

适用于施工过程中必须发生，但在投标时难以具体分项预测的措施项目，如夜间施工费、二次搬运费等。

分包法计价

在分包价格的基础上增加投标人的管理费及风险费。

适用于可以分包的独立项目，如室内空气污染测试等。

成本预测与控制

进行科学的成本预测，确定成本控制目标。

分析人工费、材料费、机械使用费等直接费用，以及管理费、利润等间接费用。

通过预测确定工、料、机及间接费的控制标准，确保项目在预算内完成。

考虑市场条件

隧道工程的计价通常以每米为单位进行，具体单价会根据实际情况和工程要求进行计算。

考虑当地的材料价格、人工费用、机械设备租赁费用等市场条件，确保取费的合理性。

安全设施和辅助工程费用

考虑安全设施、监控、通风、消防、照明等费用，这些费用虽不直接体现在工程实体上，但对工程的整体质量和安全至关重要。

其他费用

包括混凝土拌和费用、运输费用、地震处理、坍塌处理、溶洞处理、地下水处理、超前地质预报费用等。

建议

详细工程量清单：编制详细的工程量清单，明确各项工作的工作量，为准确计价提供依据。

市场调研：进行充分的市场调研，了解当地材料、人工、机械等的市场价格，确保取费符合市场行情。

合理分摊费用：对于难以准确预测的费用，采用参数法或分包法进行合理分摊，确保费用分配的合理性。

加强成本控制：在施工过程中加强成本控制，定期进行成本分析和预测，及时调整施工计划和取费策略，确保项目成本控制在预算范围内。

通过以上方法和建议，可以确保短隧道施工的取费既合理又符合市场行情，为项目的顺利进行提供有力保障。