办理跨省施工手续需要遵循以下步骤：

申请外出经营活动税收管理证明

到公司所在地的税务局申请开具《外出经营活动税收管理证明》。

填写《纳税人填开外出经营税收管理证明单申请表》，并提交税务登记证副本、外出经营合同等资料。

办理报验登记

携带《外出经营活动税收管理证明》到工程所在地的税务机关办理报验登记。

缴纳相关税费

在工程所在地使用当地发票，并就地缴纳流转环节税收（如营业税、城建税、教育费附加等）。

企业所得税需回公司所在地缴纳。

办理其他必要手续

工商备案：企业法人异地施工需进行备案登记，提交营业执照、施工单位资质、中标合同、法定代表人及项目负责人身份证及任职文件、公章等原件进行审查。

安全生产许可证：向工程所在地的安全生产监督管理部门申请领取。

建筑工程施工许可：向工程所在地的住房和城乡建设主管部门申请办理。

人力资源和社会保障关系转移手续：办理必要的员工劳动关系转移。

资质备案：在工程所在地进行资质备案，以便主管部门监管施工活动。

计划生育合同：与备案工程所在地建设行政主管部门签订计划生育合同。

合同备案：提交建设工程施工备案表以及施工合同的原件和复印件，并在工程所在地的建设行政主管部门备案。

办理核销手续

工程结束后，在工程所得地结清税款和发票注销，并回公司所在地办理外经证缴销。

利用政务服务平台

可以通过政府门户网站进行网上申报和备案手续，以简化办事流程。

建议在办理跨省施工手续时，提前咨询当地税务局、建设行政主管部门和安全生产监督管理部门，了解具体要求和流程，确保手续顺利办理。