对大学在建工程进行审计，应遵循以下原则和方法：

审计原则

事前审计、事中审计和事后审计相结合：从项目准备阶段开始介入，对工程前期环节层层把关，施工过程中不断对工程的成本列支进行监督和修正，在后续阶段对项目的建设标准、规模以及投资效果进行审查和评价。

技术经济审查与审计控制和审计评价相结合：贯穿于项目建设的各个阶段，对工程的质量和造价产生直接影响，是对工程内部审计质量控制的关键一步。

以促进控制工程造价和规范工程管理为重点，并充分关注造价、工期、质量三者关系。

注意与建设工程管理部门、工程监理机构、造价咨询机构的协调与沟通。

审计程序

获取或编制在建工程明细表，核对明细账与总账的余额是否相符。

检查在建工程项目、规模是否经授权批准。

抽查年度在建工程增加数的原始凭证是否齐全，会计处理是否正确。

检查已完工程项目以及其他转出数的原始凭证是否齐全，会计处理是否正确。

检查在建工程账户年末余额构成内容，并到工程现场实地观察、了解工程项目的实际完工进度，查看未安装设备的实际存在。

检查是否存在已交付使用，但未办理竣工交付使用手续，未及时进行会计处理的项目。

检查在建工程合约，以确定约定资本性支出。

验明在建工程是否已在资产负债表上恰当披露。

审计内容

投资立项阶段的审计：通过参与建设工程项目的立项论证过程，审查与评价拟上报的可行性研究报告或项目申请报告的真实性、完整性，为领导层提供决策依据，规避投资风险，提高投资效益。

勘察设计阶段的审计：审查和评价勘察、设计阶段各环节业务管理活动的真实、合法和效益，结合工程技术经济指标，提高本阶段内部控制及风险管理的适当性和有效性。

施工阶段的审计：对建设工程项目实施过程中隐蔽工程的勘验、主要材料及设备的价格确认、工程进度款的拨付、设计变更和施工签证的认定以及索赔事项的核实等各环节业务管理活动的真实、合法和效益进行审查和评价，促进施工过程规范管理，有效控制工程造价。

竣工验收阶段的审计：对建设工程项目的合同履行、工程结算以及工程项目决算等各环节业务管理活动的真实、合法和效益进行审查和评价，保证工程项目结算和决算的真实、完整、准确，防止虚列工程、套取资金、弄虚作假、高估冒算等行为的发生，促进合同的有效执行，维护学校的合法权益。

通过以上审计原则、程序和内容，可以有效控制工程造价，规范工程管理，确保在建工程项目的顺利进行和合规性。