南京的理科为主的大学包括但不限于以下几所：

南京理工大学：

以工科为主，尤其在化工、材料、环境等领域有优势。

南京航空航天大学：

以航空航天民航为特色，以理工类为主的综合性全国重点大学。

河海大学：

以水利为特色，工科为主，多学科协调发展。

南京邮电大学：

以工科为主，工、理、管、文、教、经多学科协调发展。

南京信息工程大学：

以气象、海洋、大气科学等特色专业闻名。

南京工业大学：

以工科为主，尤其在化工、材料、环境等领域有优势。

南京林业大学：

中央与江苏省共建，以江苏省管理为主的多科性大学。

南京医科大学：

教育部、国家卫生和计划生育委员会、江苏省人民政府三方共建，卓越医生教育培养计划试点高校。

南京中医药大学：

中医药特色，多学科协调发展。

南京师范大学：

以师范教育为主，同时拥有理工科相关专业。

以上信息根据最近更新的数据整理而来，具体排名和特色请参考官方最新发布的资料或教育部门的信息