南京拥有众多高等教育机构，其中包括一些著名的综合性大学和重点大学。以下是部分南京的大学列表：

南京大学- 教育部直属的全国重点大学，"双一流"A类世界一流大学建设高校。

东南大学- 教育部直属的全国重点大学，"双一流"A类世界一流大学建设高校，原四大工学院之一。

南京航空航天大学- 工业和信息化部直属的全国重点大学，以理工类为主。

南京理工大学- 教育部直属的全国重点大学。

河海大学- 教育部直属的全国重点大学。

南京农业大学- 教育部直属的全国重点大学，"双一流"、"211工程"重点建设高校。

中国药科大学- 教育部直属的全国重点大学。

南京师范大学- 教育部直属的全国重点大学。

南京邮电大学- 教育部直属的全国重点大学。

南京财经大学- 教育部直属的全国重点大学。

南京审计大学- 教育部直属的全国重点大学。

南京工业大学- 教育部直属的全国重点大学。

南京信息工程大学- 教育部直属的全国重点大学。

南京林业大学- 教育部直属的全国重点大学。

南京中医药大学- 教育部直属的全国重点大学。

南京医科大学- 教育部直属的全国重点大学。

南京铁道职业技术学院- 教育部直属的职业技术学院。

南京艺术学院- 教育部直属的艺术学院。

中国人民解放军陆军工程大学- 解放军直属的工程类高等军事工程技术院校。

东南大学成贤学院- 东南大学举办的独立学院。

南京航空航天大学金城学院- 南京航空航天大学举办的独立学院。

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