南京理工大学的优势专业排名如下：

武器系统与工程

全国排名第1名

该专业是国防重点建设专业，主要研究武器系统的总体设计等。

武器发射工程

全国排名第2名

在武器系统发射技术等方面处于国内领先地位。

探测制导与控制技术

全国排名第2名

化学工程与工艺

全国排名第7名

该学科在材料制备、性能研究等方面成果突出。

材料科学与工程

全国排名第10名

该学科在材料制备、性能研究等方面成果突出。

自动化

全国排名第11名

在控制理论等方向研究水平较高，毕业生就业前景广阔。

机械工程

全国排名第6名

是传统优势专业，在机械设计等方面技术积累深厚。

计算机科学与技术

全国排名第38名

光学工程

全国排名第8名

控制科学与工程

全国排名第11名

这些专业在全国的排名较高，体现了南京理工大学在这些领域的较强实力。建议考生在报考时优先考虑这些专业。