自建房办理房产证的费用主要包括以下几个方面：

登记费

住宅：每套80元。

非住宅：每件550元。

测绘费

住宅：每平方米1.3元。

非住宅：每平方米2元。

证书工本费

每本10元。

印花税

房产证印花税为5元/本。

契税

根据房屋交易价格的一定比例征收，一般为1%-3%。具体税率根据房屋面积、购房套数等因素确定。

其他费用

如果涉及抵押登记等相关手续，还可能产生抵押登记费等费用，具体标准各地有所差异。

建议

了解当地政策：由于各地的政策和经济发展条件不同，具体费用可能会有所差异。建议咨询当地的房管部门或不动产登记中心，获取最准确的信息。

准备齐全材料：办理房产证需要提供一系列材料，如身份证、土地使用权证、建设规划许可证等，确保材料齐全，以免增加额外费用。

考虑测绘面积：测绘费的计算基于实际测绘面积，因此准确测量房屋面积有助于预估测绘费用。

总体而言，办理自建房房产证的费用因房屋面积、价值等因素而异，一般在几百元到上千元不等。具体费用以当地不动产登记部门的规定和实际情况为准。