东莞的大学包括 香港城市大学（东莞）和 东莞城市学院。

香港城市大学（东莞），简称港城大（东莞），坐落于大湾区综合性国家科学中心先行启动区（松山湖科学城），是香港城市大学在大湾区举办的合作大学。大学所在区域聚集了国家级大科学装置散裂中子源、南方光源研究测试平台等大科学装置，以及华为等新型研发机构和高新技术企业。

东莞城市学院，是由广东鸿发投资集团有限公司举办的本科层次民办普通高等学校。其前身为东莞理工学院城市学院，2004年6月经教育部批准为独立学院，于2021年5月经教育部批准转设，更名为东莞城市学院。学校位于东莞市寮步镇松山湖大道旁（文昌路1号），交通便利，环境优美。校园规划用地1228亩。