自考结束后申请毕业的流程通常包括以下几个步骤：

确认个人信息：

登录自学考试管理系统，核对个人信息，包括姓名、性别、身份证号码、电子照片和各科成绩等。

打印《毕业生登记表》：

在系统中打印《毕业生登记表》，并仔细核对信息，填写相关内容。

单位签署意见：

将《毕业生登记表》交所在单位（非在职人员由街道办事处或乡人民政府）填写思想品德表现并加盖公章。

上传申请资料：

再次登录自考毕业办理系统，根据提示上传所需的毕业申请材料，如身份证正反面照片、准考证、成绩单等。

提交申请并缴费：

确认信息无误后，提交毕业申请并缴纳相应的审定费。

等待审核：

在规定时间内登录自考毕业办理系统，查看审核结果。

领取毕业证书：

审核通过后，等待自考毕业证发放。

请注意，具体的申请时间和流程可能因地区而异，建议及时关注当地教育考试机构发布的最新公告，以确保不错过申请时机。